马来西亚分东马，西马两部分。西马位于泰国和新加坡之间，位于东马的婆罗洲和印度尼西亚共享国界和广阔的婆罗洲岛。赤道直接穿过该地区，因此东马被覆盖在茂密的热带雨林和戏剧性的山脉中，被大海环绕着。这里的海岛被清澈见底的海水包围着，马来西亚是一个十分令人惊叹的理想度假胜地，无论在沙滩上放松，前往偏远的原始洞穴和山脉探索，还是体验水肺潜水，探索丛林，旅客可以尽情享受不同的娱乐方式。

想要体验马来西亚最佳的潜水目的地，就要前往马来西亚的婆罗洲的沿海各地探索，如：诗巴丹国家公园(Sipadan National Park)，拉央拉央岛(Layang-Layang)。这些岛屿因其丰富的海洋生物和原是健康的珊瑚礁生态系统而举世闻名。马来西亚政府一年四季都在保护这些岛屿的原始生态系统，并严格限制了各个区域的每日潜水员名额。因此，想要在此地潜水必须持有有效的许可证，当然，这是潜水活动经营商的责任，旅客不必为此事担心。游轮潜水(船宿)之旅是想要前往诗巴丹国家公园的旅客首选，这样可以保证旅客每天都可以在公园内潜水，而不必在度假村里坐等许可。

拉央拉央岛(Layang-Layang)是锤头鲨群(又称：双髻鲨)的热点行动之地，尤其是每年三月下旬至次年五月初，潜水员可以在浅海珊瑚礁周围看到大群的锤头鲨，锤头鲨群一般在水下30米以上活动。由于该岛本质上是一个军事基地，该地区不断打击着偷猎者和渔船，甚至在雨季也不间断。

诗巴丹(Sipadan)则是大量海龟聚集筑巢之地，还有著名的梭鱼以龙卷风形式出场，大眼宽竹荚鱼一年四季可见。潜水员还可以看到许多不同的礁鲨，如灰礁鲨，白礁鲨等，此外每年年初的几个月里锤头鲨群都会在此被发现。

婆罗洲的雨季是从每年十一月至次年二月期间，而旱季则被认为是从五月直至十月。但不管怎样，拉央拉央岛只在每年三月至八月期间向旅客开放。诗巴丹则全年都可出行，但仅有一只潜水游轮准许承载潜水员在诗巴丹潜水，其他的潜水员仅能通过度假村潜水的方式在诗巴丹潜水。